270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5295 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  57.98 
 
 		 197 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1535  TetR family transcriptional regulator  60.11 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  42.41 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 201 aa  98.2  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 200 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 200 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 200 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 199 aa  91.3  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4255  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  34.72 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  28.65 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  30.98 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  25.13 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  31.52 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  29.59 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  30.91 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6347  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
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NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_3001  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
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NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
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NC_009338  Mflv_3153  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.755786  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
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NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
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