232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7526 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  397  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  55.06 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  49.43 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  46.59 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  45.66 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 196 aa  128  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 249 aa  104  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 266 aa  99  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 200 aa  98.2  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  37.63 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 194 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 200 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 200 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 194 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 383 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 190 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  35.37 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  39.43 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 228 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  30.17 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  32.12 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  37.75 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  32.93 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1545  hypothetical protein  29.3 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  31.95 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
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NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
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NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
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NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  29.84 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  38.62 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  34.44 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  30.95 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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