255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1535 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1535  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  370  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  78.53 
 
 		 197 aa  290  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  60.11 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  60.11 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  60.11 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  40.53 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  39.15 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 211 aa  97.8  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 210 aa  92  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 237 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 199 aa  88.2  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  29.95 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4255  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  31.09 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  34.06 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 199 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 209 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  32.58 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  24.32 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 383 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  29.28 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0492  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.496213  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
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NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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