More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4073 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  64.67 
 
 		 206 aa  221  9e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 204 aa  134  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 200 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 206 aa  114  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  39.59 
 
 		 203 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  35.18 
 
 		 202 aa  97.8  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 192 aa  95.5  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 194 aa  95.5  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 224 aa  94  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  39.26 
 
 		 249 aa  92.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  35.57 
 
 		 203 aa  92.8  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  37.8 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 200 aa  92  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 191 aa  91.7  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 214 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 214 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  32.52 
 
 		 266 aa  87.8  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 383 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1163  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370888  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  36.42 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 230 aa  81.3  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  34.95 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 248 aa  78.2  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  32.62 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 189 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 200 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  36.91 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
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NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1545  hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418833 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
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NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
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NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  32.32 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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