224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7464 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



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Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
200 aa  403  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  77 
 
 
200 aa  323  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  77 
 
 
200 aa  323  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 
208 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
205 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 
206 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 
216 aa  92  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 
193 aa  91.3  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  34.78 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 
202 aa  85.9  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
196 aa  86.3  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 
188 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 
230 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
210 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 
248 aa  71.6  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 
199 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  44.05 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  32.04 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 
198 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1545  hypothetical protein  27.53 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  32.65 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1163  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370888  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 
191 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  36.17 
 
 
189 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
204 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  28.65 
 
 
217 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
188 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4883  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00152311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
194 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
194 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
231 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  29.71 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 
201 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  30.36 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 
225 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  30.5 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  39.8 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  41.94 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 
193 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 
214 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 
219 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
200 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  30.94 
 
 
224 aa  58.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  29.1 
 
 
213 aa  57.8  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  28.92 
 
 
202 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 
202 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
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NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  28.74 
 
 
266 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  24.07 
 
 
179 aa  57  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
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NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
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NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
191 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35435 
 
 
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