More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2482 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 230 aa  448  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  92.53 
 
 		 188 aa  314  6e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  86.21 
 
 		 188 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 193 aa  95.5  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  36.82 
 
 		 213 aa  95.1  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 205 aa  90.1  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 193 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 200 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1541  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 191 aa  74.7  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  33.17 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  32.18 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  53.73 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  34.32 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  34.87 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  34.98 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 383 aa  65.1  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  31.63 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  29.14 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  38.76 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  31.05 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
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NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
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NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
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