More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4603 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  100 
 
 		 211 aa  408  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  60.51 
 
 		 200 aa  224  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  60.85 
 
 		 202 aa  221  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  58.46 
 
 		 200 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  57.95 
 
 		 200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  57.95 
 
 		 200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  61.58 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 208 aa  122  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0492  TetR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.496213  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 187 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1821  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3153  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 215 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.755786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  36.09 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5233  TetR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.494471  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5613  TetR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  0.405211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5321  TetR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.868815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  31.38 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  34.54 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  34.42 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  30.99 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  29.28 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3001  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  31.1 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 201 aa  62  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  19.13 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3344  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  32 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  32.69 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  34.73 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>