191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5233 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5233  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
184 aa  360  9e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.494471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5321  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
184 aa  360  9e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.868815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5613  TetR family transcriptional regulator  99.46 
 
 
184 aa  358  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  0.405211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
202 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  37.59 
 
 
211 aa  79  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
208 aa  77.8  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1821  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3153  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.755786  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0492  TetR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
193 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.496213  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
234 aa  61.6  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 
383 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  44.07 
 
 
211 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
200 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
213 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  41.27 
 
 
194 aa  58.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
223 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 
191 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
202 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3001  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 
207 aa  54.7  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 
211 aa  54.3  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 
228 aa  54.3  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  35.38 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 
215 aa  53.9  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  31.2 
 
 
222 aa  53.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 
203 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  40.68 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3344  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
212 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 
216 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
200 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 
245 aa  51.6  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
191 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
191 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
201 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0325  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
202 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.690003 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
272 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
191 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 
225 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  30.65 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 
224 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  35.62 
 
 
213 aa  48.9  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
213 aa  48.5  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
231 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 
194 aa  48.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 
200 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
234 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
191 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 
194 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 
192 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 
202 aa  48.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
195 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
318 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
316 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
273 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
317 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
231 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
200 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
273 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0336  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
204 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153342  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
273 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0346  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
318 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
318 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
316 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
316 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
207 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal 
 
 
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NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
318 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 
178 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
273 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
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NC_009719  Plav_2851  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
204 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313937  normal 
 
 
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NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 
188 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
276 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal 
 
 
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NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
272 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  31.86 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
209 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
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NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 
199 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
194 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
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NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 
224 aa  47  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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