207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2677 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  410  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 213 aa  121  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  39.27 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  40.96 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 204 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1592  regulatory protein TetR  40.76 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 214 aa  101  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  34.22 
 
 		 196 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 197 aa  99.8  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0164  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 234 aa  93.2  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 196 aa  88.6  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 228 aa  88.6  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  33 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  35.52 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  32.54 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  34.01 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  31.41 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  31.19 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  33.53 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  32.97 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  36.17 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2681  regulatory protein TetR  26.15 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0096  transcriptional regulator  27.46 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 191 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  35.29 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  32.86 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0492  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.496213  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  25.36 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  31.41 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>