141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0630 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  425  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2681  regulatory protein TetR  33.68 
 
 		 200 aa  111  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0096  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130454  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  24.62 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0164  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  26.63 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  29.8 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  27.42 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  25.52 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  23 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  26.92 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  25.5 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1592  regulatory protein TetR  28.42 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  31.43 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6347  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  23.74 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  30.95 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 383 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 216 aa  48.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 190 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 188 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  21.08 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  23.41 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  26.26 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0161  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0325  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.690003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0333  regulatory protein TetR  24.49 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.104773  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 335 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  29.47 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 234 aa  45.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  30.23 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0336  TetR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153342  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0346  TetR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  22.55 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  21.37 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3685  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3832  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>