More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2221 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  41.95 
 
 
206 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 
208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
200 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
200 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  41.04 
 
 
209 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  43.35 
 
 
203 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
205 aa  105  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 
248 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 
196 aa  99  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 
230 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 
206 aa  91.3  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 
188 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  40.11 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 
193 aa  88.2  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
216 aa  85.1  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 
190 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  36.53 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  40.37 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  40.37 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  40.37 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 
202 aa  79  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  32.75 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  35.59 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  30.61 
 
 
197 aa  72  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  35.09 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
383 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6347  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  35.45 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
287 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1163  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370888  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  46.07 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  30.32 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 
223 aa  64.7  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
191 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
191 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 
234 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  33.76 
 
 
266 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
191 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  39.42 
 
 
188 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 
201 aa  62.4  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 
188 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
187 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
231 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
195 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal 
 
 
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NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
210 aa  62  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal 
 
 
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NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
205 aa  61.6  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
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