137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3173 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  61.21 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  60.61 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  57.99 
 
 		 187 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  50.54 
 
 		 189 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  56.36 
 
 		 181 aa  178  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  51.6 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  49.73 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  51.37 
 
 		 195 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1661  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 180 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0333899  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 187 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 173 aa  159  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  41.61 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  40.61 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  45.56 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 205 aa  84.7  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  37.75 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  32.45 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  37.81 
 
 		 230 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  45.45 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  39.23 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  38.85 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  31.33 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1163  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370888  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  32 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  29.55 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  19.74 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 383 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  31.52 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 191 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4255  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  31.87 
 
 		 188 aa  48.5  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  35.66 
 
 		 188 aa  48.1  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  32.57 
 
 		 194 aa  48.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  34.19 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>