More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3287 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  387  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  78.97 
 
 		 195 aa  306  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  63.49 
 
 		 191 aa  224  9e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  63.49 
 
 		 191 aa  224  9e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  62.11 
 
 		 189 aa  222  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 185 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 245 aa  88.2  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 209 aa  88.2  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 209 aa  84.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  59.65 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 383 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  28.41 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6347  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4255  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5732  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  30.86 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5353  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5442  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  30.26 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  28.14 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  29.75 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
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NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
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NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
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NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  32.24 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  30.29 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
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