205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7144 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 188 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  65.96 
 
 		 210 aa  240  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  42.71 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  42.78 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  40.56 
 
 		 181 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 194 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 209 aa  104  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 185 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 185 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 187 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 187 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  38.12 
 
 		 189 aa  95.9  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  36.84 
 
 		 202 aa  95.5  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  38.29 
 
 		 206 aa  92  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 209 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 173 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  36.22 
 
 		 203 aa  88.2  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 195 aa  85.5  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1661  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0333899  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  38.06 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4883  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00152311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1545  hypothetical protein  28.83 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  36.72 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 199 aa  62  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  29.94 
 
 		 266 aa  62  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  32.28 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  31.64 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  32.99 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1163  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370888  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 383 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>