143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1533 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  100 
 
 		 203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  34.84 
 
 		 194 aa  85.5  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 383 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  39.72 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  31.41 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1163  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370888  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1545  hypothetical protein  28.07 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  31.68 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4883  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00152311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5169  hypothetical protein  36 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27231  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  29.71 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  32.9 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  32.3 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  32.12 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  28.31 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  31.68 
 
 		 189 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  28.74 
 
 		 181 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 178 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 249 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 173 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1661  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0333899  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350094 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>