142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4786 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  100 
 
 		 189 aa  367  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  55.19 
 
 		 185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  54.35 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  58.18 
 
 		 187 aa  185  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  54.04 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  52.12 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  51.52 
 
 		 181 aa  168  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 187 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 173 aa  158  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  53.94 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 195 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1661  TetR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0333899  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  37.02 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  42.01 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  43.16 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 199 aa  64.3  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 201 aa  62  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  43.16 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  17.26 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  31.68 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  43.43 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 230 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 249 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 228 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 200 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  32.57 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  34.35 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  30.22 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  36.08 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  36.11 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  32.29 
 
 		 211 aa  45.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 200 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  29.74 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  29.45 
 
 		 213 aa  44.7  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>