More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4993 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
202 aa  401  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 
203 aa  155  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  45.27 
 
 
205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  41.92 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 
230 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  45.03 
 
 
287 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  42.49 
 
 
231 aa  118  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 
245 aa  114  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 
383 aa  101  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 
200 aa  101  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
200 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
200 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
200 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  33.85 
 
 
222 aa  96.3  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 
194 aa  94.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
191 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  31.22 
 
 
211 aa  91.3  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
192 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 
228 aa  85.5  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  39.49 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 
206 aa  79  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  28.57 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  32.07 
 
 
224 aa  72  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 
208 aa  71.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  32.48 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  30.89 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  36.42 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  27.6 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  41.41 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
194 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  32.46 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
214 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  38.98 
 
 
191 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  54.69 
 
 
201 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
191 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  31.11 
 
 
202 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 
199 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
208 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 
206 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
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NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
200 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
200 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
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NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 
199 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
213 aa  62  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 
209 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
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NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 
213 aa  61.2  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal 
 
 
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NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  27.23 
 
 
235 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal 
 
 
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