More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14850 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  100 
 
 
224 aa  440  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 
228 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 
234 aa  142  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  43.56 
 
 
204 aa  138  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  42.78 
 
 
193 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  42.58 
 
 
231 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 
200 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 
192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  34.47 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
383 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 
185 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
193 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  35.64 
 
 
195 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
209 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
192 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 
222 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 
215 aa  95.5  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 
199 aa  93.2  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 
194 aa  92.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  41.22 
 
 
201 aa  92.4  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  33.17 
 
 
222 aa  91.7  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
237 aa  91.7  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
194 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
194 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
217 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
194 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
210 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 
194 aa  88.6  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  32.26 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  33.01 
 
 
204 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 
192 aa  86.3  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  33.83 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  34.36 
 
 
217 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 
191 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 
230 aa  85.1  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  32.21 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  36.36 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  36.6 
 
 
194 aa  82  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 
204 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 
202 aa  82  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
202 aa  82  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 
204 aa  82  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 
204 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
188 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 
208 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0164  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
208 aa  79  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 
215 aa  79  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  31.8 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 
249 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  31.43 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  47.13 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
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NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  28.8 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 
200 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
208 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
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NC_009719  Plav_2851  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313937  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
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NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  30.32 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
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NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal 
 
 
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NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal 
 
 
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NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal 
 
 
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NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  34.7 
 
 
210 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
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NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 
200 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 
208 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.166406 
 
 
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NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal 
 
 
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