290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4851 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  417  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  97.61 
 
 		 209 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  34.8 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 193 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 215 aa  91.3  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 194 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 194 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 192 aa  89  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 287 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  32.82 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  31.98 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  36.09 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  28.22 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  25.82 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  30 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  34.73 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  28.44 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  31.47 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 202 aa  62  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3344  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
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NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  28.77 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
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NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
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NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_6347  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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