More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2281 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  34.2 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  46.25 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  40.91 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  41.41 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  46.75 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  48.31 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  56.36 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  53.97 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  37.4 
 
 		 194 aa  62  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4851  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  42.5 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  55.77 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3393  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  37.8 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  38.82 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  42.03 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  47.22 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5233  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.494471  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5613  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  0.405211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5321  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.868815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  46.55 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 187 aa  52.4  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 194 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 189 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3330  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537262 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 178 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  36.19 
 
 		 182 aa  51.6  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  37.39 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>