159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12090 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 182 aa  355  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 237 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  39.56 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 208 aa  101  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 199 aa  101  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 199 aa  95.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 216 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 216 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 216 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  43.53 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  32.26 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1661  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0333899  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1535  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3001  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  28 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 187 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 194 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  29.51 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  30.32 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 215 aa  51.6  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 185 aa  51.2  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 202 aa  51.2  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  51.2  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  30.09 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  45.1 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  38.96 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  29.01 
 
 		 266 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1545  hypothetical protein  30.19 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 214 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 214 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 214 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  27.54 
 
 		 202 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  21.29 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 185 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  30.51 
 
 		 202 aa  47.8  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 178 aa  47.8  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 383 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>