More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3001 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3001  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  407  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  45.2 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  38.58 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 194 aa  95.5  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  41.06 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 191 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 191 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 209 aa  84.7  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  38.42 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  33.15 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 245 aa  71.2  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  33.09 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  31.55 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  58.49 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  31.07 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  36.71 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  30.77 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5233  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.494471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5321  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.868815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  44.09 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_5613  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  0.405211 
 
 
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NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
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NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
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NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  34.5 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
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NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
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