More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2593 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  401  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 202 aa  225  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  48.77 
 
 		 203 aa  175  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  45.27 
 
 		 202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 287 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 200 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 200 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 200 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 245 aa  92  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  30.37 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  32.12 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  35 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  33.84 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  34.16 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  38.27 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  32.72 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  28.93 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  50.75 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  31.64 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  44.21 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  31.77 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>