297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0014 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  447  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 225 aa  144  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 202 aa  92.8  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 383 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  43.27 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  37.4 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  33.73 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 209 aa  62  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 209 aa  62  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  28.49 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19500  transcriptional regulator, tetR family  31.68 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  32.7 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  34.27 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  32.73 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1945  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 199 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  32.45 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  32.06 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  31.61 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 191 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 185 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 191 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 182 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  43.53 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 185 aa  52  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1477  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>