More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1434 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 185 aa  346  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  42.08 
 
 		 204 aa  128  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  41.21 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 383 aa  114  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  38.25 
 
 		 224 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 228 aa  104  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 216 aa  96.3  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 231 aa  94  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  41.9 
 
 		 202 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 192 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 206 aa  89.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 210 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  33.89 
 
 		 202 aa  87.4  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 205 aa  85.1  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 209 aa  84.3  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  40.91 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  35.33 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  37.2 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  33.14 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  31.35 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  41.35 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  45.35 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  35.6 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  37.41 
 
 		 266 aa  71.6  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  41.27 
 
 		 188 aa  70.9  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  36.43 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  38.52 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  43.52 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 213 aa  67.8  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  33.51 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 196 aa  67  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  29.35 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  36.55 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>