270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3528 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
192 aa  370  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  56.61 
 
 
204 aa  215  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 
193 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
215 aa  99.4  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 
204 aa  94  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 
234 aa  89  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 
228 aa  87.8  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 
224 aa  87.8  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  35.87 
 
 
224 aa  86.3  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  35.52 
 
 
192 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  31.82 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
193 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  34.92 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 
210 aa  71.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  39.19 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  38.85 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  40.15 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  40.15 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 
198 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
200 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  53.97 
 
 
215 aa  63.2  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  36.42 
 
 
195 aa  63.2  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 
208 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
216 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
194 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 
245 aa  62.8  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
189 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
189 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
194 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
194 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 
214 aa  61.6  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 
191 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
205 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  35.64 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 
204 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 
185 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 
214 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  36.67 
 
 
204 aa  59.3  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
202 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  33 
 
 
203 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
200 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
200 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
200 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
200 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  38.46 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
237 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
215 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 
249 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
232 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
214 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  37.32 
 
 
208 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
214 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
214 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 
202 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 
215 aa  55.1  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 
182 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 
202 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
195 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 
199 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  31.21 
 
 
211 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
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NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
219 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  32.35 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
213 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
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NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  29.29 
 
 
213 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  28.65 
 
 
217 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
225 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
220 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal 
 
 
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NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal 
 
 
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NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
214 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
214 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
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NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
213 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
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