215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3757 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  400  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 215 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  35.18 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 195 aa  101  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  44.74 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0164  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  32.8 
 
 		 201 aa  92  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  34.47 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1592  regulatory protein TetR  35.11 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  36.46 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  34.1 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0096  transcriptional regulator  31.98 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130454  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  38.06 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  32.12 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2681  regulatory protein TetR  27.1 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  31.55 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  38.85 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  26.57 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  33.97 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  38.56 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  32.45 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  32.62 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  35.46 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  30.96 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  31.55 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  35.8 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  31.68 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 182 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 178 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  35.66 
 
 		 266 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>