223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4740 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  54.4 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  56.38 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  40.1 
 
 		 202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  38.04 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 213 aa  87.8  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  29.74 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 213 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  37.93 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  27.54 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 217 aa  64.3  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  35.64 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 204 aa  62  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  28.14 
 
 		 266 aa  62  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  28.78 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  33.76 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6347  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  28.57 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 383 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  26.47 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  25.26 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  29.45 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0164  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 248 aa  53.9  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  37.23 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0740  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  0.856133 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2681  regulatory protein TetR  26.44 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  34.21 
 
 		 182 aa  52.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>