More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4620 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  374  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 194 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 194 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 230 aa  84.7  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  39.38 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  38.56 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 231 aa  74.3  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 383 aa  71.2  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  37.75 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  28.49 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  36.91 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  37.27 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  46.07 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  38.56 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  34.53 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 228 aa  64.3  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  34.34 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  29.56 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  43.53 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  36.88 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  38.3 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  48.39 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  50.63 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  29.58 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  35.58 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  34 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>