222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4502 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
249 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  66.48 
 
 
216 aa  229  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 
204 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  43.5 
 
 
205 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 
203 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 
196 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 
208 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  35.39 
 
 
200 aa  99  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
200 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
200 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 
209 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  38.22 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  38.22 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  38.22 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  38.01 
 
 
206 aa  86.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
200 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
205 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 
194 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  35.4 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 
185 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 
185 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  36.93 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 
206 aa  72  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  38.22 
 
 
173 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
210 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
195 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  38.52 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
194 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  33.52 
 
 
202 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  36.2 
 
 
189 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  31.82 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  30.99 
 
 
181 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
205 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  31.76 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 
214 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 
205 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 
192 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
213 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
213 aa  62.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 
194 aa  62  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 
199 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 
193 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
195 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2066  hypothetical protein  73.68 
 
 
127 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.431541  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 
188 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
188 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
209 aa  60.1  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  29.67 
 
 
194 aa  59.7  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  39.69 
 
 
188 aa  59.7  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
209 aa  59.7  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 
185 aa  59.3  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
193 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  29.74 
 
 
222 aa  58.9  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
191 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 
201 aa  58.5  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1661  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
180 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0333899  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 
182 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  48.61 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2851  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
204 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313937  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
209 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  33.09 
 
 
195 aa  57.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
220 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
185 aa  56.6  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
191 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  30.36 
 
 
181 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
231 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 
204 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  41.23 
 
 
203 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
191 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
191 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
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NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
208 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_1545  hypothetical protein  32.84 
 
 
186 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.418833 
 
 
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NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
191 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35435 
 
 
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NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 
224 aa  55.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
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NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
192 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.109313 
 
 
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