173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1023 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  100 
 
 		 196 aa  383  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  39.77 
 
 		 195 aa  99  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 213 aa  95.1  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  39.04 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 206 aa  84.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 204 aa  84.7  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0096  transcriptional regulator  31.44 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130454  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  37.24 
 
 		 235 aa  78.2  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1592  regulatory protein TetR  35.52 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0164  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  24.62 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  54.1 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  32.65 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2681  regulatory protein TetR  26.44 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 214 aa  62  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  35.2 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 383 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  31.64 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  36.55 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  36.64 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 187 aa  52.4  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  32.86 
 
 		 266 aa  52  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  30.56 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  38.96 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  38.64 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  31.44 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 287 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  32.17 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  36.67 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 248 aa  48.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>