More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0893 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  100 
 
 		 194 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 202 aa  95.5  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  38.85 
 
 		 178 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 200 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 200 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 200 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  35.5 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  27.21 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  32.5 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  46.74 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 213 aa  77.8  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  35.39 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 383 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  28.74 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  30.32 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 287 aa  71.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  34.54 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 216 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 216 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 216 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  32.2 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3344  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  35.37 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  55 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  52.46 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  34.34 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  24.35 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>