180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0011 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 179 aa  363  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  27.21 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 202 aa  72  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  22.7 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  21.2 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  21.2 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  21.2 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  23.24 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  22.83 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  30.05 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  23.91 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  19.23 
 
 		 228 aa  64.3  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  20.11 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  22.02 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  21.62 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  20.88 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  22.75 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  19.13 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  17.68 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  18.39 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  20.37 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  20.37 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  20.75 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  21.86 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  20.13 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  22.42 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  20.78 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  21.52 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  22.49 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  18.58 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  18.95 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  17.26 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  20.12 
 
 		 181 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  21.7 
 
 		 213 aa  52  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  18.38 
 
 		 216 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  18.38 
 
 		 216 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  18.38 
 
 		 216 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  19.32 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  21.18 
 
 		 199 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  21.34 
 
 		 210 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  19.67 
 
 		 217 aa  51.2  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  21.21 
 
 		 188 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  19.57 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  18.12 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4255  TetR family transcriptional regulator  19.66 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  21.7 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  22.4 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3344  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  22.65 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  22.89 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  21.64 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  19.89 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  20.95 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  20.45 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5233  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.494471  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  22.1 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5321  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.868815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  19.79 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  19.67 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5613  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  0.405211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  23.04 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  21.29 
 
 		 182 aa  48.5  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>