More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4433 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
199 aa  397  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  61.66 
 
 
204 aa  243  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
237 aa  218  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  52.31 
 
 
199 aa  210  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 
208 aa  181  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  43.46 
 
 
210 aa  150  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 
207 aa  118  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  41.14 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 
201 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
191 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
191 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
191 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
191 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  34.97 
 
 
182 aa  99.8  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
191 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 
202 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 
200 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
191 aa  95.5  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
192 aa  94.7  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 
234 aa  92.8  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
217 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  38.2 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 
205 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
200 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
200 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
200 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
200 aa  85.1  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
216 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
216 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
216 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  32.42 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
224 aa  82  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  32.48 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3001  transcriptional regulator, TetR family  40.71 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 
202 aa  79  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  34.94 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  32.69 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
383 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
210 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 
245 aa  71.6  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
214 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
214 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
200 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.109313 
 
 
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NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  29.1 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
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NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000686866 
 
 
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NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
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NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 
248 aa  64.7  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
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