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for query gene Gobs_4219 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
202 aa  394  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
200 aa  124  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
383 aa  118  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 
199 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 
211 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 
200 aa  98.6  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 
223 aa  98.6  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  38.12 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 
208 aa  95.9  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  36.99 
 
 
194 aa  95.5  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
204 aa  95.5  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
194 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
194 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
194 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 
213 aa  94  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
192 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 
234 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 
194 aa  91.7  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  32.26 
 
 
222 aa  91.3  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 
217 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
191 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
193 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
185 aa  88.6  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
231 aa  88.2  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 
194 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  31.91 
 
 
217 aa  86.3  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
287 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 
208 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  36.18 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  32.12 
 
 
211 aa  82  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  31.68 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 
205 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  31.64 
 
 
202 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  30.94 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 
230 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  30.06 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0011  transcriptional regulator, putative  23.2 
 
 
179 aa  72  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 
201 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 
212 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
189 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
189 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  33.52 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 
230 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal 
 
 
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NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
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NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
213 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
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