More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3813 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 222 aa  438  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 		 193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 231 aa  138  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  45.6 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  41.81 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  38.3 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 383 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  34.08 
 
 		 202 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 192 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 192 aa  92.8  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 217 aa  85.1  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 224 aa  85.1  7e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 192 aa  85.1  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 189 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 189 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 199 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  31.72 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  30.15 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  30 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  34.78 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  30.89 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  30.32 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  30.65 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  35 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  30.58 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  26.06 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  27.69 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  34.62 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  29.89 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  34.24 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 203 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>