More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4818 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 237 aa  201  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  52.02 
 
 		 199 aa  194  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  51.28 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  40.84 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 207 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  36.55 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  38.46 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 217 aa  99  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  36.55 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 224 aa  95.5  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  36.95 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 224 aa  88.6  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 213 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 383 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 202 aa  85.1  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 201 aa  84.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 206 aa  84.7  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  33.14 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  34.72 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6347  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  54.32 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  65.52 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3001  transcriptional regulator, TetR family  41.04 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  33.73 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  34.73 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  29.26 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  27.08 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  31.75 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
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NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
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NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
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NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
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NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
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NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
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NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
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