More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3270 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  407  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  69.63 
 
 		 198 aa  284  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  70.31 
 
 		 191 aa  276  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 199 aa  121  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 209 aa  101  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 217 aa  98.2  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 200 aa  92  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 194 aa  88.6  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 199 aa  88.2  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 231 aa  88.2  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 287 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2851  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 383 aa  87  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  34.59 
 
 		 266 aa  86.3  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 216 aa  85.9  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 234 aa  85.1  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  30.19 
 
 		 211 aa  84.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  27.96 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  29.59 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  25.4 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  30.91 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  32.03 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
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NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
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NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_19500  transcriptional regulator, tetR family  28.09 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
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NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
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NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  26.63 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_1545  hypothetical protein  25.97 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418833 
 
 
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NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
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