221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28220 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  387  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 213 aa  150  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  40.54 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 214 aa  100  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  39.77 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  35.36 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  39.27 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0164  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  34.39 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 193 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1592  regulatory protein TetR  34.95 
 
 		 193 aa  85.1  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  39.26 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  26.63 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2681  regulatory protein TetR  27.04 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0096  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130454  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  37.21 
 
 		 188 aa  62  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  29.94 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  35.51 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  37.24 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  33.77 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  28.87 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  30.1 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  50 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>