146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0164 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0164  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  414  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1592  regulatory protein TetR  55.62 
 
 		 193 aa  157  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  45.88 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 213 aa  141  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  39.7 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  39.15 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  35.33 
 
 		 195 aa  106  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 206 aa  104  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  40.54 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 224 aa  85.1  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  31.41 
 
 		 197 aa  85.5  6e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  36.73 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  30.58 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0096  transcriptional regulator  30.26 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  31.19 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  29.73 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  27.68 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  29.17 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  28.23 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 383 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  29.03 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  29.75 
 
 		 266 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2681  regulatory protein TetR  25.13 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  29.28 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000321459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>