More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4158 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  408  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 		 219 aa  141  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  38.42 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  34.95 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 224 aa  71.2  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  30.96 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  37.69 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  33.15 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  31.07 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  31.29 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  28.65 
 
 		 224 aa  62  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  32.82 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3344  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>