More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0455 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  437  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  46.04 
 
 		 218 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2371  TetR family transcriptional regulator  48.66 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.533189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  44.51 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  44.81 
 
 		 238 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 217 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 230 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 255 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  36.94 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  37.75 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 214 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 232 aa  128  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 233 aa  124  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 266 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 273 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 226 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  32.99 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  35.1 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 210 aa  99  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 211 aa  92.4  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  38.46 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  39.32 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 209 aa  72  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
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NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  28.37 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
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NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
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NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
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NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
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NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
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NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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