More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1098 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  78.95 
 
 		 209 aa  339  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 228 aa  171  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  43.43 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  40.1 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  41.41 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  40.1 
 
 		 218 aa  147  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  36.87 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  42.31 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  35.27 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  38.59 
 
 		 210 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 219 aa  131  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 214 aa  127  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 224 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 266 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 247 aa  121  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 243 aa  121  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  38.62 
 
 		 264 aa  121  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 235 aa  117  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 273 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2371  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.533189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 218 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 233 aa  85.1  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  31.18 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 289 aa  78.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  31.28 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  33.09 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  37.78 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
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NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  27.13 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
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NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  28.96 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
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NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
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