More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3412 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  84.95 
 
 		 206 aa  343  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  76.21 
 
 		 207 aa  324  7e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 228 aa  228  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  46.23 
 
 		 213 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 210 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  48.5 
 
 		 210 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  44.39 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  38 
 
 		 230 aa  151  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  41.95 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 266 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 232 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 273 aa  128  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  39.47 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 255 aa  118  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  34.12 
 
 		 264 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 233 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  31.87 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2371  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.533189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2368  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000142624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 289 aa  64.7  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  31.72 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 234 aa  62  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0455  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0937341  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0503  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0503  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4869  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  30.06 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.26 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0048  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.25 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.25 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.25 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_006274  BCZK0363  TetR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0375  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0366  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.100088  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0389  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0433  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
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NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
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