More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_pXO1_0048 on replicon NC_007322
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007322  GBAA_pXO1_0048  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  394  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 289 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  28.74 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 287 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  28.44 
 
 		 251 aa  53.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  30.53 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 232 aa  52.4  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 234 aa  51.6  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 213 aa  51.2  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 250 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 540 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4153  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  29.17 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  27.35 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 217 aa  48.5  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  36.76 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 233 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  25.44 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 225 aa  48.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0940  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00130273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 202 aa  48.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 201 aa  47.8  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 203 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 213 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0125  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 238 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.493759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 233 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.28 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3093  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0252517 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 307 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 233 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.28 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 453 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.28 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>