More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0103 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  375  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  95.79 
 
 		 190 aa  363  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 184 aa  164  9e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 203 aa  74.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  27.22 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  41.11 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  24.64 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 218 aa  67.8  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1083  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  25.51 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 195 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  29.85 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 324 aa  64.7  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 287 aa  64.7  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  31.91 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 211 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 438 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  29.87 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0578  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  45.9 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>