More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3221 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  477  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 205 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 202 aa  126  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 197 aa  85.9  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 204 aa  62  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  44.07 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  44.07 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  44.07 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  44.07 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  44.07 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  44.07 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  44.07 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  36.25 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  26.52 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  29.07 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1817  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  40.24 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 183 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4037  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.766436 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 310 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  37 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  25.96 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3105  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>