284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1074 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  367  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  367  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  97.33 
 
 		 187 aa  336  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 190 aa  157  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3055  transcriptional regulator, TetR family  56.04 
 
 		 189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  43.93 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 218 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  34.38 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  36.98 
 
 		 215 aa  96.3  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 193 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 193 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 193 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 208 aa  87.8  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 211 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 198 aa  85.9  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 210 aa  84.3  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  31.93 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  31.28 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  29.51 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  71.2  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  47.5 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 239 aa  51.6  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6471  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 205 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 226 aa  51.2  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 233 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 258 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  32.81 
 
 		 246 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 217 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  38.03 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 238 aa  48.9  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 222 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 219 aa  48.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 204 aa  48.1  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 246 aa  48.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 203 aa  47.8  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 212 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>