146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4918 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  383  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  60.11 
 
 		 200 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 194 aa  95.1  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  29.75 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  28.85 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  32.04 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  31.79 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  29.05 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 185 aa  51.2  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 219 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 232 aa  48.9  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3093  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0252517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  31.19 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 246 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4749  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  41.82 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  41.82 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2765  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.829891 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1703  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 106 aa  45.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 226 aa  45.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 233 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  45.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 220 aa  45.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 232 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 424 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  43.18 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 269 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  30.26 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>