More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2249 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  436  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  43.81 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  40.41 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  43.01 
 
 		 196 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  40.8 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  38.69 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 193 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 193 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  39.49 
 
 		 194 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  38.24 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  40.1 
 
 		 200 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 205 aa  99.4  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 185 aa  95.9  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 187 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 187 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 187 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 190 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3055  transcriptional regulator, TetR family  40.1 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6471  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10262  hypothetical protein  31.36 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.277133  normal  0.125869 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  27.61 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  35.71 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 258 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  37.5 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 258 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 247 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 255 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 205 aa  52.8  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>